В 1986 году Алтайский госуниверситет возглавил ректор Валерий Леонидович Миронов.
В 1993 году в университете было уже 10 факультетов и отделений, в составе которых 54 кафедры, 19 специальностей, 6000 студентов.
Среди ППС 2 члена-коррреспондента РАН, 39 докторов наук и профессора, 238 кандидатов наук.
В 1991 году впервые выпускником АлтГУ Евгением Павловичем Глушаниным защищена докторская диссертация.
В этом же году открыт первый диссертационный совет по защите кандидатских диссертаций по социологии.
В 1990 году введен в эксплуатацию физический корпус на пр. Красноармейском.