У ВКГУ им. С. Аманжолова с Алтайским госуниверситетом подписан договор о сотрудничестве с 2012 года. За это время между университетами двух стран установились крепкие партнерские отношения.
Ежегодно от 5 до 10 преподавателей АлтГУ читают лекции в ВКГУ. Магистранты проходят стажировку на различных кафедрах Алтайского государственного университета. Преподаватели из Казахстана проходят курсы повышения квалификации в АлтГУ.
В свою очередь, преподаватели и молодые ученые АлтГУ также стажируются в ВКГУ. Результатом такого сотрудничества становятся совместные научные разработки, статьи в программных материалах научных конференций.