Аннотация рабочей программы дисциплины
«Молекулярное моделирование и биоинформатика»

Цель изучения дисциплины Формирование системных знаний, умений и навыков в области молекулярного моделирования лекарственных веществ.
Место дисциплины в учебном плане Б1.В.ДВ.01.03
Формируемые компетенции ОПК-1, ОПК-2, ПК-1
Знания, умения и навыки, получаемые в результате освоения дисциплины
Знать:
теоретические основы молекулярного моделирования лекарственных веществ и биополимеров, способы учета влияния внешней среды, методы оптимизации геометрии и минимизации энергии, методы конформационного анализа, фармакофорного поиска и прогнозирования биологической активности;
Уметь:
создавать модели молекул биологически активных соединений и проводить расчеты их характеристик с использованием специализированного программного обеспечения, проводить фармакофорный поиск, прогнозировать биологическую активность молекулярных моделей методами 3D-QSAR;
Иметь навыки и (или) опыт деятельности (владеть):
методами молекулярного моделирования биополимеров и лекарственных веществ, навыками фармакофорного поиска, основными методами 3D-QSAR и программными средствами прогнозирования биологической активности.
Содержание дисциплины Методы получения пространственных координат и оптимизации геометрии молекулярных структур. Конформационный анализ. Потенциалы молекулярных взаимодействий. Фармакофорный поиск. Методы исследования количественных соотношений пространственная структура – активность (методы 3D-QSAR). Моделирование малых молекул на примере антагонистов дофаминового рецептора подтипа D3.
Виды учебной работы Лекции, практические, самостоятельная работа.
Используемые информационные, инструментальные и программные средства
Microsoft Windows
Microsoft Office
7-Zip
AcrobatReader
Организация взаимодействия с обучающимися посредством электронной почты, скайпа;
Компьютерное тестирование (с использованием системы Moodle);
Система управления обучением на основе модульной динамической учебной среды «Moodle», предназначенная для автоматизации процессов управления обучением, предоставления доступа к электронному образовательному контенту и реализации электронных образовательных технологий. Пользователи системы: Преподаватели и сотрудники университета, обучающиеся всех форм обучения, слушатели курсов повышения квалификации.
Электронная библиотека ФГБОУ ВО "Алтайский государственный университет"
www.konkurs.dnttm.ru – обзор исследовательских и научно-практических юношеских конференций, семинаров конкурсов и пр
http://www.inion.ru/product/db_2.htm - Институт научной информации по общественным наукам Российской Академии Наук (ИНИОН РАН)
http://fuji.viniti.msk.su/ - Всероссийский институт научной и технической информации (ВИНИТИ)
http://www.nlr.ru:8101/ - Российская национальная библиотека
Доступ онлайн Электронная библиотека eLIBRARY.RU
Форма промежуточной аттестации Экзамен.