| Цель изучения дисциплины | 1. Изучить и освоить принципы молекулярного моделирования. 2. Осуществлять поиск и разработку лекарсвтенных средств. |
|---|---|
| Место дисциплины в учебном плане | Б1.О.03 |
| Формируемые компетенции | ПК-1 | Знания, умения и навыки, получаемые в результате освоения дисциплины |
Знать:
теоретические основы молекулярного моделирования лекарственных веществ и биополимеров, способы учета влияния внешней среды, методы оптимизации геометрии и минимизации энергии, методы конформационного анализа, фармакофорного поиска и прогнозирования биологической активности, методы и способы разработки лекарственных средств; Уметь:
создавать модели молекул биологически активных соединений и проводить расчеты их характеристик с использованием специализированного программного обеспечения, проводить фармакофорный поиск, прогнозировать биологическую активность молекулярных моделей методами 3D-QSAR, разрабатывать методики создания лекарственных средств; Иметь навыки и (или) опыт деятельности (владеть):
методами молекулярного моделирования биополимеров и лекарственных веществ, навыками фармакофорного поиска, основными методами 3D-QSAR и программными средствами прогнозирования биологической активности, навыками создания лекарственных средств. |
| Содержание дисциплины | Молекулярное моделирование и процесс разработки лекарственных средств. Методы QSAR и методы докинга. Молекулярная динамика и оценка энергий взаимодействия лекарственных средств. Моделирование метаболома и оценка стабильности субстанций. |
| Виды учебной работы | Лекции, практические, самостоятельная работа. |
| Используемые информационные, инструментальные и программные средства |
Программное обеспечение для молекулярного моделирования и конструирования, прогнозирования биологической активностиMicrosoft Office 2010 (Office 2010 Professional, № 4065231 от 08.12.2010), (бессрочно);
Microsoft Windows 7 (Windows 7 Professional, № 61834699 от 22.04.2013), (бессрочно); Chrome (http://www.chromium.org/chromium-os/licenses), (бессрочно); 7-Zip (http://www.7-zip.org/license.txt), (бессрочно); AcrobatReader (http://wwwimages.adobe.com/content/dam/Adobe/en/legal/servicetou/Acrobat_com_Additional_TOU-en_US-20140618_1200.pdf), (бессрочно); ASTRA LINUX SPECIAL EDITION (https://astralinux.ru/products/astra-linux-special-edition/), (бессрочно); LibreOffice (https://ru.libreoffice.org/), (бессрочно); Веб-браузер Chromium (https://www.chromium.org/Home/), (бессрочно); Антивирус Касперский (https://www.kaspersky.ru/), (до 23 июня 2024); Архиватор Ark (https://apps.kde.org/ark/), (бессрочно); Okular (https://okular.kde.org/ru/download/), (бессрочно); Редактор изображений Gimp (https://www.gimp.org/), (бессрочно) 1. Персональный компьютер и компьютерные сети.
2. Операционная система (Microsoft Windows и др.). 3. Офисные приложения (Microsoft Office Word, Exel, PowerPoint и др.). 4. Программное обеспечение для просмотра файлов в форматах PDF, DJV и DJVu (Adobe Reader, WinDjView и др.). 5. Программное обеспечение для работы с архивированными файлами и папками (WinRAR, 7-Zip и др.). 6. Программное обеспечение для графического дизайна и создания схем (SmartDraw, CorelDRAW и др.). 7. Программное обеспечение для анализа и визуализации научных и статистических данных (SigmaPlot, Origin и др.). 8. Базы данных молекулярных структур (PDB и др.). 9. Электронная почта. 10. Поисковые системы (Google, Yandex и др.). |
| Форма промежуточной аттестации | Диф. зачет. |