| Закреплена за кафедрой | Кафедра зоологии и физиологии |
|---|---|
| Направление подготовки | 06.04.01. Биология |
| Профиль | Биоразнообразие, молекулярная генетика и биоресурсы |
| Форма обучения | Очная |
| Общая трудоемкость | 3 ЗЕТ |
| Учебный план | 06_04_01_Биология_БМГиБ-2025 |
|
|
||||||||||||
Распределение часов по семестрам
| Курс (семестр) | 2 (4) | Итого | ||
|---|---|---|---|---|
| Недель | 16 | |||
| Вид занятий | УП | РПД | УП | РПД |
| Лекции | 12 | 12 | 12 | 12 |
| Лабораторные | 20 | 20 | 20 | 20 |
| Сам. работа | 76 | 76 | 76 | 76 |
| Итого | 108 | 108 | 108 | 108 |
| 1.1. | Цель: формирование целостного представления о процессах молекулярной эволюции, закономерностях изменения геномов и методах реконструкции филогенетических отношений. Задачи: - ознакомить с основными концепциями и теориями молекулярной эволюции; - сформировать навыки построения и интерпретации филогенетических деревьев; - усвоить основные принципы работы с последовательностями ДНК, РНК и белков в эволюционном контексте; - применять биоинформатические инструменты для анализа эволюционных данных. |
|---|
| Цикл (раздел) ООП: Б1.О.05 |
| ПК-1 | Способен осуществлять научно-исследовательскую работу в области изучения живых организмов и биологических систем различных уровней организации и представлять результаты в выбранной области исследования |
| ПК-1.1 | Знает теоретические основы, методологию и методы исследования в выбранной области |
| ПК-1.2 | Умеет осуществлять научно-исследовательскую работу в области биодиверсикологии |
| ПК-1.3 | Владеет навыками обработки полученных результатов и их представления |
| В результате освоения дисциплины обучающийся должен | |
| 3.1. | Знать: |
|---|---|
| 3.1.1. | основные закономерности и механизмы молекулярной эволюции; теории и модели эволюционных процессов; принципы выравнивания последовательностей и сравнительного анализа геномов; методы построения филогенетических деревьев и критерии их оценки; возможности и ограничения современных биоинформатических пакетов и баз данных. |
| 3.2. | Уметь: |
| 3.2.1. | работать с международными базами данных биологических последовательностей; выполнять парное и множественное выравнивание нуклеотидных и аминокислотных последовательностей; строить и интерпретировать филогенетические деревья с применением различных методов; использовать статистические подходы для проверки гипотез; оформлять и представлять результаты анализа в научной и учебной форме. |
| 3.3. | Иметь навыки и (или) опыт деятельности (владеть): |
| 3.3.1. | практическими приемами биоинформатического анализа последовательностей; навыками работы с современными программными пакетами; методами интеграции филогенетических данных с результатами популяционно-генетических и геномных исследований; умением критически оценивать публикации и результаты исследований в области молекулярной эволюции. |
| Код занятия | Наименование разделов и тем | Вид занятия | Семестр | Часов | Компетенции | Литература |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Раздел 1. Основы филогенетики и молекулярной эволюции | ||||||
| 1.1. | Основы филогенетики: понятия, термины, подходы | Лекции | 4 | 1 | ПК-1.1 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.2 |
| 1.2. | Источники филогенетической информации: морфология, последовательности, геномы | Лекции | 4 | 1 | ПК-1.1 | Л1.1, Л1.2, Л2.3, Л2.4 |
| 1.3. | Множественное выравнивание и проблемы его точности | Лекции | 4 | 1 | ПК-1.1 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.3 |
| 1.4. | Работа с базами данных и подготовка последовательностей для анализа | Лабораторные | 4 | 4 | ПК-1.2 | Л1.1, Л1.2, Л2.2, Л2.3 |
| 1.5. | Множественное выравнивание последовательностей | Лабораторные | 4 | 4 | ПК-1.2 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.3 |
| 1.6. | Нейтральная теория эволюции | Сам. работа | 4 | 20 | ПК-1.1 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.2 |
| Раздел 2. Эволюционные модели и алгоритмы анализа | ||||||
| 2.1. | Эволюционные модели нуклеотидных и аминокислотных замен | Лекции | 4 | 1 | ПК-1.1 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.3 |
| 2.2. | Методы построения деревьев: расстояния (UPGMA, NJ) и максимальная парсимония | Лекции | 4 | 2 | ПК-1.1 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.4 |
| 2.3. | Построение филогенетических деревьев методами расстояний (Neighbor-Joining, UPGMA) | Лабораторные | 4 | 4 | ПК-1.2 | Л1.1, Л1.2, Л2.2, Л2.3 |
| 2.4. | Методы молекулярной датировки и калибровка молекулярных часов | Сам. работа | 4 | 20 | ПК-1.1 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.2 |
| Раздел 3. Вероятностные методы и достоверность анализа | ||||||
| 3.1. | Метод максимального правдоподобия и Байесовский анализ в филогенетике | Лекции | 4 | 2 | ПК-1.1 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.2 |
| 3.2. | Методы оценки достоверности деревьев | Лекции | 4 | 2 | ПК-1.1 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.2 |
| 3.3. | Вероятностные методы филогенетики | Лабораторные | 4 | 4 | ПК-1.2, ПК-1.3 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.3 |
| 3.4. | Оценка достоверности и визуализация филогенетических деревьев | Лабораторные | 4 | 4 | ПК-1.2, ПК-1.3 | Л1.1, Л1.2, Л2.3, Л2.4 |
| 3.5. | Современные программы и онлайн-сервисы для филогенетики | Сам. работа | 4 | 20 | ПК-1.1 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.4 |
| Раздел 4. Филогеография и современные приложения молекулярно-филогенетических методов | ||||||
| 4.1. | Филогеография: методы и примеры | Лекции | 4 | 2 | ПК-1.1 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.2, Л1.3, Л2.3 |
| 4.2. | Филогеномика и анализ больших данных | Сам. работа | 4 | 16 | ПК-1.1 | Л1.1, Л1.2, Л2.1, Л2.2 |
| 5.1. Контрольные вопросы и задания для проведения текущего контроля и промежуточной аттестации по итогам освоения дисциплины |
| ПК-1. Способен осуществлять научно-исследовательскую работу в области изучения живых организмов и биологических систем различных уровней организации и представлять результаты в выбранной области исследования Вопросы и задания для оценки сформированности компетенции: Примеры заданий закрытого типа: 1. Кто считается основателем нейтральной теории молекулярной эволюции? a) Ч. Дарвин b) Т. Добжанский c) М. Кимура + d) Ф. Крик 2. Что лежит в основе метода Neighbor-Joining? a) Максимизация правдоподобия b) Минимизация числа замен c) Минимизация суммарных длин ветвей + d) Байесовский подход 3. Какой формат чаще всего используется для хранения последовательностей ДНК? a) DOCX b) FASTA + c) XLSX d) PDF 4. Что показывает метод bootstrap в филогенетике? a) Скорость мутаций b) Степень достоверности узлов дерева + c) Количество гомологий d) Время дивергенции 5. Как называется метод, основанный на минимизации общего числа эволюционных событий? a) Максимальная парсимония + b) Максимальное правдоподобие c) Байесовский анализ d) Neighbor-Joining 6. Какой ресурс является основной международной базой нуклеотидных последовательностей? a) UniProt b) GenBank + c) PDB d) Pfam 7. Что такое молекулярные часы? a) Метод калибровки эволюционных моделей b) Гипотеза о постоянной скорости накопления замен + c) Биоинформатическая программа d) Метка времени в базе данных 8. Какой метод филогенетического анализа является вероятностным? a) Максимальная парсимония b) Максимальное правдоподобие + c) Neighbor-Joining d) UPGMA 9. Какой вид мутаций лежит в основе молекулярной эволюции? a) Репликационные ошибки + b) Эпигенетические модификации c) Изменения числа хромосом d) Рекомбинация 10. Какая теория утверждает, что большинство мутаций эволюционно нейтральны? a) Теория катастроф b) Нейтральная теория + c) Теория панспермии d) Теория эмерджентности 11. Что оценивает показатель «posterior probability» в байесовской филогенетике? a) Количество замен в узле b) Вероятность гипотезы при данных + c) Надёжность модели выравнивания d) Время дивергенции 12. Что является основным ограничением метода молекулярных часов? a) Отсутствие древних ДНК b) Неравномерность скорости эволюции + c) Недоступность белковых последовательностей d) Ограниченность баз данных 13. Какая база данных содержит аннотированные белковые последовательности? a) GenBank b) UniProt + c) EMBL d) KEGG 14. Как называется процесс передачи генетического материала между неродственными организмами? a) Горизонтальный перенос генов + b) Вертикальная наследственность c) Конвергенция d) Рекомбинация 15. Что является основным результатом множественного выравнивания последовательностей? a) Построение филогенетического дерева b) Матрица гомологичных позиций + c) Молекулярные часы d) Bootstrap-значения Примеры заданий открытого типа: 1. Объясните, в чём заключается нейтральная теория молекулярной эволюции. Пример ответа: Большинство мутаций нейтральны и не влияют на приспособленность; эволюция на молекулярном уровне определяется главным образом генетическим дрейфом, а не отбором. 2. В чём различие между глобальным и локальным выравниванием последовательностей? Пример ответа: Глобальное выравнивание (Needleman–Wunsch) выравнивает всю последовательность от начала до конца; локальное (Smith–Waterman, BLAST) ищет наиболее похожие фрагменты. 3. Перечислите основные методы построения филогенетических деревьев. Пример ответа: Методы расстояний (UPGMA, Neighbor-Joining), методы оптимизации (максимальная парсимония), вероятностные методы (максимальное правдоподобие, байесовский анализ). 4. Что показывает bootstrap-анализ при построении филогенетических деревьев? Пример ответа: Надёжность ветвей дерева, выраженную в процентах повторяемости при ресемплировании данных. 5. Объясните понятие «молекулярные часы». Пример ответа: Гипотеза о приблизительно постоянной скорости накопления замен в молекулярных последовательностях, что позволяет оценивать время дивергенции видов. 6. В чём преимущество байесовских методов в филогенетике? Пример ответа: Байесовский подход позволяет получать апостериорные распределения по деревьям и моделям эволюции, что дает информацию о степени уверенности в каждом конкретном выводе, а не только о наиболее вероятных сценариях. 7. Какие данные можно использовать в качестве источников филогенетической информации? Пример ответа: Морфологические признаки, последовательности ДНК, РНК и белков, геномные структуры, хромосомные перестройки. 8. Почему множественное выравнивание является критическим этапом в филогенетическом анализе? Пример ответа: От качества выравнивания зависит корректность выделения гомологичных позиций, что напрямую влияет на достоверность дерева. 9. Объясните различие между максимальной парсимонией и максимальным правдоподобием. Пример ответа: Парсимония минимизирует число замен; ML ищет дерево, которое делает наблюдаемые данные наиболее вероятными при заданной модели замен. 10. Что означает понятие «гомология» в молекулярной эволюции? Пример ответа: Сходство последовательностей, обусловленное общим происхождением (в отличие от аналогии, вызванной конвергентной эволюцией). 11. Перечислите основные программы для построения филогенетических деревьев. Пример ответа: MEGA, RAxML, IQ-TREE, MrBayes, BEAST, PHYLIP. 12. В чём суть метода Neighbor-Joining? Пример ответа: Итеративное объединение таксонов по минимальной эволюционной дистанции с целью минимизации суммарной длины дерева. 13. Для чего используется программа FigTree? Пример ответа: Для визуализации, редактирования и аннотирования филогенетических деревьев. 14. В чём заключается значение филогеографии? Пример ответа: Позволяет связать генетическое разнообразие с географическим распределением организмов, реконструировать пути миграции и расселения. 15. Какие ограничения имеет гипотеза молекулярных часов? Пример ответа: Скорости эволюции не всегда постоянны; разные гены и линии могут эволюционировать с разной скоростью. 16. Объясните роль дупликации генов в молекулярной эволюции. Пример ответа: Дупликация создаёт копии генов, которые могут приобрести новые функции (неофункционализация) или разделить старые (субфункционализация). 17. Что такое горизонтальный перенос генов и в каких группах организмов он особенно распространён? Пример ответа: Передача генетического материала между неродственными организмами; широко распространён у прокариот, а также у вирусов. 18. Какую роль играет выбор модели эволюции нуклеотидных замен? Пример ответа: Корректная модель повышает точность построения дерева; неправильная модель может исказить топологию. 19. Для чего используется программа BEAST? Пример ответа: Для байесовского анализа филогенетических деревьев и оценки времени дивергенции с использованием молекулярных часов. 20. Что такое филогеномика и какие задачи она решает? Пример ответа: Филогеномика — построение филогенетических деревьев на основе больших наборов геномных данных; решает задачи реконструкции эволюции больших групп организмов и поиска эволюционных закономерностей. |
| 5.2. Темы письменных работ для проведения текущего контроля (эссе, рефераты, курсовые работы и др.) |
| 1. История развития идей молекулярной эволюции. 2. Нейтральная теория молекулярной эволюции: достижения и критика. 3. «Почти нейтральная теория» Т. Охты и её значение для современной эволюционной биологии. 4. Гомология и аналогия в молекулярной эволюции: примеры и критерии различия. 5. Источники филогенетической информации: сравнительный анализ морфологических и молекулярных данных. 6. Современные базы данных последовательностей: GenBank, EMBL, DDBJ. 7. UniProt как ресурс для филогенетических исследований. 8. Алгоритмы множественного выравнивания: Clustal Omega, MUSCLE, MAFFT. 9. Проблемы точности множественного выравнивания и способы их решения. 10. Филогенетические модели замен нуклеотидов: от Jukes-Cantor до GTR. 11. Модели замен аминокислот и их применение в эволюционных исследованиях. 12. Метод максимальной парсимонии: возможности и ограничения. 13. Методы расстояний в филогенетике: UPGMA и Neighbor-Joining. 14. Максимальное правдоподобие как вероятностный метод построения деревьев. 15. Байесовские методы в филогенетике: теоретические основы и программная реализация. 16. Оценка достоверности филогенетических деревьев: bootstrap, posterior probability. 17. Программы для построения филогенетических деревьев: сравнительный анализ (MEGA, RAxML, IQ-TREE, MrBayes). 18. Современные инструменты визуализации деревьев: FigTree, iTOL. 19. Проблемы интерпретации филогенетических деревьев. 20. Молекулярные часы и методы калибровки: теоретические основы и практическое применение. 21. BEAST как инструмент молекулярной датировки. 22. Филогеография: методы и примеры исследований. 23. Применение филогенетики в эпидемиологии (на примере ВИЧ, SARS-CoV-2 и других вирусов). 24. Горизонтальный перенос генов: примеры и последствия для филогенетики. 25. Дупликация генов как источник эволюционных инноваций. 26. Конвергентная эволюция на молекулярном уровне. 27. Эволюция митохондриального генома и его использование в филогенетике. 28. Хлоропластные геномы как источник филогенетической информации у растений. 29. Метагеномные данные и их использование в молекулярной филогенетике. 30. Филогеномика: принципы и перспективы развития. 31. Методы анализа больших данных в филогенетике. 32. Проблемы построения «Древа жизни» в эпоху филогеномики. 33. Вклад биоинформатики в развитие молекулярной филогенетики. 34. Применение филогенетических методов в систематике и таксономии. 35. Будущее молекулярной филогенетики: новые подходы и вызовы. |
| 5.3. Фонд оценочных средств для проведения промежуточной аттестации |
| 1. Предмет и задачи филогенетики. 2. Нейтральная теория молекулярной эволюции. 3. Гомология и аналогия: критерии различия. 4. Ортологи, паралоги и ксенологи. 5. Источники филогенетической информации. 6. Базы данных нуклеотидных последовательностей. 7. Базы данных белков. 8. Методы глобального и локального выравнивания. 9. Алгоритмы множественного выравнивания. 10. Проблемы и точность множественного выравнивания. 11. Эволюционные модели замен нуклеотидов. 12. Эволюционные модели замен аминокислот. 13. Метод максимальной парсимонии. 14. Методы расстояний: UPGMA и Neighbor-Joining. 15. Метод максимального правдоподобия. 16. Байесовские методы в филогенетике. 17. Bootstrap и другие методы оценки достоверности деревьев. 18. Применение «молекулярных часов» в филогенетическом анализе. 19. Способы построения и визуализации филогенетических деревьев. 20. Проблемы интерпретации филогенетических деревьев. 21. Молекулярные часы: принципы и ограничения. 22. Методы калибровки молекулярных часов. 23. Дупликация генов и её роль в эволюции. 24. Горизонтальный перенос генов. 25. Конвергентная и дивергентная эволюция. 26. Эволюция митохондриального генома. 27. Эволюция хлоропластного генома. 28. Филогеография: методы и примеры. 29. Применение филогенетики в эпидемиологии. 30. Метагеномика и филогенетический анализ. 31. Филогеномика и анализ больших данных. 32. Современные проблемы построения «Древа жизни». |
| 6.1. Рекомендуемая литература | ||||
| 6.1.1. Основная литература | ||||
| Авторы | Заглавие | Издательство, год | Эл. адрес | |
| Л1.1 | Лукашов В.В. | Молекулярная эволюция и филогенетический анализ: учебное пособие | Москва: Лаборатория знаний, 2009 | |
| Л1.2 | Ней М., Кумар С. | Молекулярная эволюция и филогенетика: | М.: Энциклопедия, 2025 | |
| Л1.3 | Avise J.C. | Phylogeography: The History and Formation of Species: | Cambridge, MA: Harvard University Press, 2000 | |
| 6.1.2. Дополнительная литература | ||||
| Авторы | Заглавие | Издательство, год | Эл. адрес | |
| Л2.1 | Felsenstein J. | Inferring Phylogenies: | Sunderland, MA: Sinauer Associates, , 2004 | |
| Л2.2 | Salemi M., Vandamme A.-M. (eds). | The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing. 2nd ed.: | Cambridge: Cambridge University Press, 2012 | |
| Л2.3 | Wiley E.O., Lieberman B.S. | Phylogenetics: Theory and Practice of Phylogenetic Systematics. 2nd ed.: | Hoboken: Wiley-Blackwell, 2011 | |
| Л2.4 | Graur D., Li W.-H. | Fundamentals of Molecular Evolution. 2nd ed.: | Sunderland, MA: Sinauer Associates, 2000 | |
| 6.2. Перечень ресурсов информационно-телекоммуникационной сети "Интернет" | ||||
| Название | Эл. адрес | |||
| Э1 | Курс на Moodle (https://portal.edu.asu.ru/course/view.php?id=13804) | portal.edu.asu.ru | ||
| Э2 | Базы данных последовательностей (GenBank) (https://www.ncbi.nlm.nih.gov) | www.ncbi.nlm.nih.gov | ||
| Э3 | Базы данных белковых последовательностей (https://www.uniprot.org) | www.uniprot.org | ||
| Э4 | Платформа для идентификации видов с использованием ДНК-штрихкодов | boldsystems.org | ||
| 6.3. Перечень программного обеспечения | ||||
| Базовое программное обеспечение (Microsoft Word; Microsoft PowerPoint; Microsoft Excel; LibreOffice (Writer, Impress, Calc); Google Docs; Adobe Acrobat Reader; R studio). Программы для множественного выравнивания последовательностей (Clustal Omega; MUSCLE; MAFFT; T-Coffee; AliView; Jalview). Программы для построения филогенетических деревьев (MEGA (Molecular Evolutionary Genetics Analysis); RAxML; IQ-TREE; MrBayes; BEAST). Визуализация филогенетических деревьев (FigTree; iTOL (Interactive Tree Of Life); Dendroscope). Программы для построения гаплотипических сетей (PopART (Population Analysis with Reticulate Trees), NETWORK (Fluxus Engineering); TCS (Templeton, Crandall, and Sing network)). | ||||
| 6.4. Перечень информационных справочных систем | ||||
| Электронная база данных «Scopus» (http://www.scopus.com); Электронная библиотечная система Алтайского государственного университета (http://elibrary.asu.ru/); Научная электронная библиотека elibrary (http://elibrary.ru) Поиск научных публикаций, статей, тезисов и книг (https://scholar.google.com); Научно-информационная социальная сеть, обмен базой публикаций (https://www.researchgate.net/). | ||||
| Аудитория | Назначение | Оборудование |
|---|---|---|
| 405Л | лаборатория беспозвоночных животных - учебная аудитория для проведения занятий лекционного типа; занятий семинарского типа (лабораторных и(или) практических); проведения групповых и индивидуальных консультаций, текущего контроля и промежуточной аттестации | Учебная мебель на 15 посадочных мест; рабочее место преподавателя – 2; лабораторные электрифицированные столы – 8 шт.; лабораторные столы – 1 шт.; доска меловая 1 шт.; раковина; шкафы для хранениятаблиц и коллекций беспозвоночных животных – 6 единиц; тумбочки – 3 единицы; телевизор JVC-290С, микромер окулярный винтовой, бинокуляры МБС-10, видеоокуляр DCM-310, микроскопы: Альтами 104, МБС-10, микромед, Микмед-1 вар. 1; коллекции беспозвоночных животных, микропрепараты по зоологии беспозвоночных и БИР |
| 404Л | лаборатория позвоночных животных - учебная аудитория для проведения занятий лекционного типа; занятий семинарского типа (лабораторных и(или) практических); проведения групповых и индивидуальных консультаций, текущего контроля и промежуточной аттестации | Учебная мебель на 15 посадочных мест; рабочее место преподавателя; доска меловая 1шт.; стационарный экран: марка dIGIS oPTIMAL-C модель MW DSOC-1103 - 1 единица; шкафы для хранения муляжей и препаратов по зоологии позвоночных – 6 шт.; лабораторные столы – 9 шт.; раковина; проектор: марка Casio модель XJ-M140 - 1 единица; телевизор Samsung CK-2139VR; бинокли: Levenhuk Atom 10x50 – 12; картографический материал, табличный материал, муляжи внутренних органов позвоночных животных, фиксированные препараты позвоночных животных, коллекции скелетов, чучел позвоночных животных |
| 320Л | медиатека, читальный зал – помещение для самостоятельной работы | Учебная мебель на 15 посадочных мест; персональные компьютеры с выходом в информационно-телекоммуникационную сеть Интернет и электронную информационно-образовательную среду; |
| 207Л | лаборатория информационных технологий - компьютерный класс - учебная аудитория для проведения занятий семинарского типа (лабораторных и(или) практических); проведения групповых и индивидуальных консультаций, текущего контроля и промежуточной аттестации | Учебная мебель на 14 посадочных мест; компьютеры: марка DEPO модель Neos 260, мониторы: марка Philips модель 227E3LHSU - 14 единиц |
| Приступая к изучению дисциплины «Молекулярная эволюция и филогенетика», студент должен ознакомиться с содержанием рабочей программы, перечнем тем лекций, лабораторных занятий и самостоятельной работы. Дисциплина включает несколько видов занятий, которые в совокупности обеспечивают её усвоение: лекции, лабораторные занятия, самостоятельную работу. Лекции являются основным источником систематизированных научных знаний. На лекциях рассматриваются ключевые понятия молекулярной эволюции и филогенетики, принципы построения филогенетических деревьев, современные модели и алгоритмы анализа эволюционных процессов, а также примеры применения методов в биологии, медицине и экологии. Лабораторные занятия занимают особое место в структуре курса. Они проводятся в компьютерных классах с использованием специализированного программного обеспечения (Clustal Omega, MEGA, RAxML, IQ-TREE, MrBayes, BEAST и др.). На лабораторных работах студенты осваивают практические навыки: подготовку и обработку последовательностей, множественное выравнивание, построение и визуализацию филогенетических деревьев, оценку достоверности результатов. По каждой лабораторной работе составляется письменный отчёт, который защищается перед преподавателем. Успешное выполнение и защита всех лабораторных работ является обязательным условием допуска к зачёту. Самостоятельная работа направлена на углубление и закрепление знаний, полученных на лекциях и лабораторных занятиях. В рамках самостоятельной работы студенты анализируют научную литературу, готовят эссе и рефераты по отдельным темам (нейтральная теория эволюции, методы молекулярной датировки, филогеография, филогеномика и др.), а также выполняют задания по обработке данных с использованием программных пакетов. Важным элементом самостоятельной работы является подготовка конспектов и сравнительных таблиц по темам, предусмотренным рабочей программой. Текущий контроль знаний проводится в ходе лабораторных занятий и включает индивидуальные опросы, проверку отчётов, выполнение тестов и практических заданий. Отдельные формы контроля могут проводиться в виде коллоквиумов или контрольных мини-работ. Результаты текущего контроля учитываются при формировании итоговой оценки. Промежуточная аттестация осуществляется в форме зачёта по завершении курса. Для получения зачёта студент должен: • посетить все лекционные и лабораторные занятия или отработать пропущенные; • выполнить и защитить все лабораторные работы; • сдать текущие задания (тесты, мини-контрольные, эссе/рефераты); • проявить активность и самостоятельность при освоении материала. Студенты, систематически выполнявшие задания и успешно прошедшие текущий контроль, могут получить зачёт в упрощённой форме (без дополнительного опроса). Для успешного освоения дисциплины студенту рекомендуется: • систематически посещать лекции и вести конспекты; • своевременно выполнять и сдавать лабораторные отчёты; • регулярно работать с рекомендуемой литературой и электронными ресурсами • уделять внимание самостоятельному анализу первоисточников и научных статей; • готовиться к зачёту на основе лекционного материала, конспектов и отчётов по лабораторным занятиям. |