Преподаваемые дисциплины
Основы биологического катализа и взаимодействий биополимеров
Образование
- Новосибирский государственный университет, 1966, специальность «химия»;
- Кандидатская диссертация «Исследование механизма действия и специфичности некоторых аминокислота-тРНК-Лигаз», Новосибирск, 1971, кандидат химических наук: 02.00.00;
- Докторская диссертация «Химическая модификация аминоацил-тРНК-синтетаз», Новосибирск, 1981, доктор химических наук: 02.00.10.
Почетные звания и другие заслуги
- Член-корреспондент РАН c 29.05.2008 - Отделение биологических наук (нанотехнологии, биохимия).
- Академик РАН c 15.11.2019 - Отделение биологических наук, Сибирское отделение РАН (физико-химическая биология).
- Лауреат Государственной премии СССР, лауреат премий Сибирского Отделения РАН, стипендиат государственной стипендии для выдающихся ученых России, иностранный профессор Парижского Университета 6 (имени Пьера и Марии Кюри), кавалер Ордена Академических Пальм.
- Почетный Соросовский Профессор. Почетный доктор Алтайского государственного университета.
- Медаль ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени.
- Член редколлегий журналов Молекулярная биология и Biochimica et Biophysica Acta, член Экспертного совета РФФИ.
Диссертации, защищенные под руководством
Под руководством защищено 3 доктора и более 30 кандидатов наук.
Профессиональные интересы
Научные интересы лежат в области изучения сложных надмолекулярных систем репликации и репарации ДНК.
Ранние работы посвящены исследованию аминоацил-тРНК синтетаз. Методом рентгеноструктурного анализа и исследованиями в растворе установлена структура комплексов фенилаланил-тРНК-синтетазы с субстратами и открыт новый механизм продуктивного узнавания тРНКPhe, зависимый от АТФ и фенилаланина.
Внесен значительный вклад в изучение систем, обеспечивающих стабильность структуры генома, открыты новые механизмы репарации ДНК и их регуляции. Установлено, что комплекс белков, осуществляющих репарацию окислительных повреждений ДНК, предформирован в виде надмолекулярной структуры – «репаросомы», оценена ее композиция. Установлена ключевая роль PARP1 и катализируемой им реакции поли(АДФ-рибозилирования) в регуляции репарации оснований и нуклеотидов. Обнаружены новые механизмы регуляции активности PARP1, осуществляемые многофункциональными РНК-связывающими белками (FUS, YB-1) и репликативным белком А.
Установлены новые мишени для разработки ингибиторов систем репарации антираковых препаратов, а также препаратов для лечения нейродегенеративных заболеваний. Разработаны эффективные ингибиторы тирозил-ДНК-фосфодиэстеразы 1 на основе синтетических аналогов природных соединений для лечения рака прямой кишки и рака легких. Эти соединения работают как сенсибилизаторы клинических препаратов, на порядки увеличивая интенсивность химиотерапии.
Профессиональная деятельность
- Общий стаж работы: 51 год;
- Стаж работы по специальности: 51 год.
Публикации
-
Nadezhda S. Dyrkheeva, Aleksandr S. Filimonov, Olga A. Luzina, Kristina A. Orlova, Irina A. Chernyshova, Tatyana E. Kornienko, Anastasia A. Malakhova, Sergey P. Medvedev, Alexandra L. Zakharenko, Ekaterina S. Ilina, Rashid O. Anarbaev, Konstantin N. Naume
New Hybrid Compounds Combining Fragments of Usnic Acid and Thioether Are Inhibitors of Human Enzymes TDP1, TDP2 and PARP1.
Int. J. Mol. Sci. 2021, 22, 11336
- Бабкина Г. Т., Кнорре В. Л., Кнорре Д. Г., Лаврик О. И. Ингибирующее действие -анилида АТФ в реакциях катализируемых аминокислот: тРНК-лигазами и ДНК-зависимой РНК-полимеразой // Доклады АН СССР. — 1974. — Т.216, N 5. — С.1165-1167.
- Невинский Г. А., Фаворова О. О., Лаврик О. И. и др. Фторзамещенные триптофаны как субстраты и ингибиторы реакции обмена АТР-Р32 -пирофосфат, катализируемой триптофанил-т РНК-ситетазой // Биохимия. — 1975. — Т.40, Вып.2. — С.368-376.
- Киселев Л. Л., Фаворова О. О., Лаврик О. И. Биосинтез белков от аминокислот до аминоацил-т РНК. — М.: Наука, 1984. — 408 с.
- Lavrik O.I., Prasad R., Sobol R.W., Horton J.K., Ackerman E.J., Wilson S.H. Photoaffinity labeling of mouse fibroblast enzymes by a base excision repair intermediate. Evidence for the role of poly(ADP-ribose) polymerase-1 in DNA repair (2001) J. Biol. Chem. 276, 25541-25548.
- Lavrik O.I., Khodyreva S.N. Photoaffinity probes in molecular biology of DNA replication and DNA repair, in: Chemical probes in Biology., Ed. Schneider M., Kluwer Academic Press, 2003, p. 193—205.
- Prasad R., Liu Y., Deterding L.J., Poltoratsky V.P., Kedar P.S., Horton J.K., Kanno S., Asagoshi K., Hou E.W., Khodyreva S.N., Lavrik O.I, Wilson S.H. HMGB1 is a cofactor in mammalian base excision repair. (2007) Mol. Cell. 27, 829—841.
- Alemasova E.E., Lavrik O.I. Poly(ADP-ribosyl)ation by PARP1: reaction mechanism and regulatory proteins. Nucleic Acids Research 47 (2019): 3811 - 3827.
- Kosova, A. A., Khodyreva, S. N., & Lavrik, O. I. (2017). Role of Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase (GAPDH) in DNA Repair. Biochemistry. Biokhimiia, 82(6), 643–654.
- Zakharenko, A. L., Drenichev, M. S., Dyrkheeva, N. S., Ivanov, G. A., Oslovsky, V. E., Ilina, E. S., Chernyshova, I. A., Lavrik, O. I., & Mikhailov, S. N. (2020). Inhibition of Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1 by Lipophilic Pyrimidine Nucleosides. Molecules (Basel, Switzerland), 25(16), 3694.
- Moor, N. A., & Lavrik, O. I. (2018). Protein-Protein Interactions in DNA Base Excision Repair. Biochemistry. Biokhimiia, 83(4), 411–422.
- Rechkunova, N. I., Maltseva, E. A., & Lavrik, O. I. (2019). Post-translational Modifications of Nucleotide Excision Repair Proteins and Their Role in the DNA Repair. Biochemistry. Biokhimiia, 84(9), 1008–1020.
- Il'ina, I. V., Dyrkheeva, N. S., Zakharenko, A. L., Sidorenko, A. Y., Li-Zhulanov, N. S., Korchagina, D. V., Chand, R., Ayine-Tora, D. M., Chepanova, A. A., Zakharova, O. D., Ilina, E. S., Reynisson, J., Malakhova, A. A., Medvedev, S. P., Zakian, S. M., Volcho, K. P., Salakhutdinov, N. F., & Lavrik, O. I. (2020). Design, Synthesis, and Biological Investigation of Novel Classes of 3-Carene-Derived Potent Inhibitors of TDP1. Molecules (Basel, Switzerland), 25(15), 3496.
- Laev, S. S., Salakhutdinov, N. F., & Lavrik, O. I. (2017). Inhibitors of nuclease and redox activity of apurinic/apyrimidinic endonuclease 1/redox effector factor 1 (APE1/Ref-1). Bioorganic & medicinal chemistry, 25(9), 2531–2544.
- Vasil'eva, I. A., Moor, N. A., & Lavrik, O. I. (2020). Effect of Human XRCC1 Protein Oxidation on the Functional Activity of Its Complexes with the Key Enzymes of DNA Base Excision Repair. Biochemistry. Biokhimiia, 85(3), 288–299.
- Maltseva, E. A., Krasikova, Y. S., Sukhanova, M. V., Rechkunova, N. I., & Lavrik, O. I. (2018). Replication protein A as a modulator of the poly(ADP-ribose)polymerase 1 activity. DNA repair, 72, 28–38.