Проректор по научной работе и международным связям
Первый проректор по научной работе и международным связям координирует работу в области научной работы и международных связей всех структур университета
Научно-исследовательский сектор
Научно-исследовательский сектор осуществляет координацию научной деятельности в университете в области фундаментальных исследований, прикладных исследований и разработок
Отдел аспирантуры и докторантуры
Координирует вопросы, связанные с приемом и обучением в аспирантуре и докторантуре
Издательство АлтГУ (редакционно-издательский отдел)
Сегодня издательство АлтГУ - крупнейший по объему центр книгоиздания на Алтае с ежегодным объемом книгоиздания ок 70 названий по разным областям науки, образования и культуры
Отдел эксплуатации оборудования
Отдел эксплуатации оборудования является основным звеном служб по эксплуатации учебного, научного оборудования, вычислительной техники, оргтехники, стандартизации и метрологии
Информационно-методический отдел
В отделе аккумулируется многообразная информация о конкурсах, программах, грантах, выставках, конференциях; также отдел обеспечивает проводимые в вузе научные исследований и разработки научно-технической и патентной информацией
Отдел международных связей
Отдел организует международное сотрудничество ученых и преподавателей университета: проводит лекции-презентации программ академического и культурного обмена, привлекает студентов и преподавателей университета к активному участию в различных международных программах и т. д.