Центр рекомбинантных технологий

Целью деятельности Центра рекомбинантных технологий (ЦРТ) является организация и проведение научных исследований теоретического и прикладного характера с использованием рекомбинантных технологий в области онкотераностики, иммунологии, молекулярной биологии и биотехнологии.

Основные направления научной деятельности:

• разработка инновационных продуктов в области онкотераностики, иммунологии,  молекулярной биологии и биотехнологии;
• проведение научно-исследовательских работ в области онкотераностики, с применением современных методов молекулярной биологии, биотехнологии, иммунологии, а также современных информационных технологий;
• реализация систематического тесного сотрудничества с научно-исследовательскими и образовательными центрами России, а также зарубежных стран при организации и выполнении научно-исследовательских и инновационных программ и проектов в области онкотераностики, иммунологии,  молекулярной биологии и биотехнологии;
• активизация фундаментального и прогностического потенциала биологических исследований в области молекулярной биологии, биофизики, биохимии и иммунологии;
• внедрение научных достижений в учебный процесс в виде разработок инновационных программ по направлениям бакалавриата, магистратуры и аспирантуры, повышение эффективности подготовки и переподготовки кадров высшей квалификации для науки и образования, а также специалистов-практиков.

ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ НАУЧНОЙ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ (проекты, гранты, хоздоговоры)

Государственные задания в рамках НИР:

• «Разработка продуцентов рекомбинантных ферментов для сыроделия»;
• «Создание иммонодиагностических и иммунотерапевтических инструментов на основе методов комбинаторной биологии»;
• «Комбинаторная биология как платформа для создания медико-биологических препаратов»;
• «Разработка лекарственных препаратов на основе синтетических пептидов для блокировки костимуляторных молекул».

Гранты Российского фонда фундаментальных исследований:

• «Использование технологии фагового дисплея для поиска пептидов специфически взаимодействующих с иммунными контрольными точками»;
• «Иммунносигнатуры для определения подтипов рака молочной железы и прогнозирования рецидива»;
• «Разработка комплексного метода выделения и in vitro анализа биологически активных фракций лекарственных растений»;
• «Получение рекомбинантных химозинов коров, верблюда и ламы и сравнительное изучение их молокосвертывающей активности»;
• «Альтернативные стратегии блокировки точек контроля иммунного ответа»;
• «Разработка иммуногена, индуцирующего наработку антител, нейтрализующих широкий спектр первичных изолятов ВИЧ-1»;
• «Получение рекомбинантного химозина со сниженной термостабильностью и изучение его свойств».

Гранты Фонда содействия инновациям:

• «Разработка генетических конструкций, обеспечивающих высокоэффективный синтез рекомбинантных ферментов в системе Bacillus subtilis».

Гранты Управления Алтайского края по пищевой, перерабатывающей, фармацевтической промышленности и биотехнологиям:

• «Создание прокариотической системы экспрессии гена рекомбинантного тканевого фактора (апопротеина III) человека».

Проекты по заказам реального сектора экономики:

• ООО «Имбиан-Лаб» – «Получение куриных поликлональных антител против рекомбинантных антигенов, Разработка системы экспрессии белка стрептолизина О в системе Bacillus subtilis, «Панель контрольных образцов ВПЧ»;
• ООО «ВакБиоЛаб» – «Конструирование рекомбинантных плазмид»;
• ООО «АПТОС» – Проведение научно-исследовательских работ по исследованию образцов коллагена и гиалуроновой кислоты.

Научные работы по заказу институтов:

• ФНЦ им. Неговского – «Определение антител к синтетическим полипептидам у пациентов при критических состояниях»;
• ИОХ СО РАН – «Изучение ингибиторов основной протеазы».
• Проекты Приоритет 2030:
• «Разработка пептидного блокатора костимуляторных молекул»;
• «Метод видоспецифичной идентификации онкогенных видов ВПЧ на основе мультиплексной ПЦР в реальном времени»;
• «Разработка универсального плазмидного вектора для экспрессии генов в дрожжах Saccharomyces boulardii».

ПЕРЕЧЕНЬ ИННОВАЦИОННЫХ РАЗРАБОТОК

Получение и изучение ряда белков, генно-инженерного и природного происхождения.

Фосфолипаза С

• Фермент, который разрушает фосфолипиды на различные продукты, такие как свободные жирные кислоты, лизофосфолипиды и пр.
• Используется для рафинации растительных масел, увеличивая срок и стабильность хранения и в качестве эмульгатора для яичного желтка при производстве майонеза.
• Является ферментом для увеличения выхода массы сыра из молока.

Рекомбинантный химозин

• Аналог фермента, который расщепляет белковую часть молока, приводя к его коагуляции.
• Используется в производстве сыра в качестве молокосвёртывающего фермента. Необходимый компонент для получения всех твердых сыров.

Мезофильная α-амилаза

• Основной пищеварительный фермент, который разрушает крахмал и гликоген до декстринов и мальтозы.
• Используется в производстве этилового спирта для расщепления крахмала в зерне до сахаров. В хлебопекарном производстве дрожжи используют простые сахара, полученные при расщеплении крахмала в муке, поэтому хлеб быстро поднимается. Компонент многих моющих средств.
• Амилаза находит медицинское применение при болезнях поджелудочной железы.

Фитаза

• Фермент, который помогает превращать фитиновую кислоту – неперевариваемую органическую форму фосфора, которая содержится в растительных кормах, в усваиваемую неорганическую форму.
• Используется в качестве кормовой добавки домашней птицы и свиней, для повышения питательной ценности растительного корма за счет увеличения доступности кальция, фосфора, минералов, углеводов, аминокислот и белков.

Рекомбинантный Белок А

• Инженерный аналог белка А, получаемого из золотистого стафиллококка, способный взаимодействовать с антителами млекопитающих.
• Используется для исследований в биологии, биотехнологии и иммунологии. Белок А соединяют с красителями для создания тест-систем на основе ИФА, ИГХ, ИХА.

Рекомбинантная Taq-полимераза

• Фермент, участвующий в процессе удвоения ДНК.
• Используется для генетических исследований (выявление предрасположенностей к болезням, определение родства), для определения вирусных заболеваний (ВПЧ, ВИЧ, гепатит, SARS-Cov-2), и для научных разработок (вакцины, антигены, антитела).

Пероксидаза хрена

• Фермент, выделенный из хрена, широко применяющийся в молекулярно-биологических методиках для усиления слабого сигнала до уровня, необходимого для детекции.
• Используется как компонент тест-полоски и тест-систем.

Конъюгаты антител для иммунохимических анализов

• Моноклональные и поликлональные антитела класса Y или белка А против белков, антител, антигенов, конъюгированные с нанозолотом, пероксидазой хрена и щелочной фосфатазой.
• Используется в иммуноферментном анализе, иммунохроматографии и блоттинге.

УЧАСТИЕ В РЕАЛИЗАЦИИ ОБРАЗОВАТЕЛЬНЫХ ПРОГРАММ УНИВЕРСИТЕТА

На базе центра рекомбинантных технологий проводятся учебные занятия по освоению методов биохимии и биотехнологии студентами Института биологии и биотехнологии. Лабораторное оборудование и расходные материалы центра активно используются в научно-исследовательских работах при подготовке выпускных квалификационных работ бакалавров, магистрантов и аспирантов. 

ВЫПУСКНЫЕ КВАЛИФИКАЦИОННЫЕ РАБОТЫ

Бакалаврские работы

2021 год

• «Изучение влияния аминокислотных замен на синтез и локализацию рекомбинантного химозина верблюда» (Щеголькова В.О.)
• «Изучение синтеза и локализации рекомбинантных аналогов химозинов Monodon monoceros L. и Physeter catodon L. В системе E. coli» (Бастрыгина Е.А.)
• «Получение рекомбинантного химозина белого медведя и тупайи и изучение их свойств» (Матузенко Е.В.)

2022 год

• «Биохимическая характеристика рекомбинантного химозина лося (Alces alces), полученного в системе экспрессии Kluyveromyces lactis» (Белаш Е.А.)
• «Получение рекомбинантного белка а и изучение его свойств» (Гайворонский С.И.)
• «Получение мутантных форм Taq-полимеразы» (Маслов Р.Д.)

2023 год

• «Разработка метода количественного определения интеграционных кассет на основе ПЦР в режиме реального времени» (Васюрина Е.А.)
• «Исcледование способности пептидов блокировать взаимодействие лиганд-рецептор на примере корегуляторных CTLA4 - B7-2» (Гаськова Е.Д.)
• «Разработка прокариотического продуцента для получения рекомбинантной фитазы» (Кузнецова Д.В.)
• «Конструирование продуцента рекомбинантной савиназы на основе Bacillus subtilis» (Матвеева И.А.)
• «Получение иммуносигнатур переболевших COVID-19 с помощью фагового дисплея» (Сусоева Е.А.)

2024 год

• «Влияние аминокислотных замен в молекуле рекомбинантного химозина коровы на его специфичность и термостабильность» (Гревцова М.Е.)
• «Конструирование экспрессионной кассеты для продукции протеазы ВИЧ-1 в клетках Escherichia coli» (Комарова А.Д.)
• «Оптимизация выделения пероксидазы из корней хрена, для получения ее конъюгата с белком А» (Фоменко А.В.)
• «Конструирование векторных систем обеспечивающих биолюминесценцию в дрожжах Saccharomyces boulardi» (Хиврич Р.Д.)

Магистерские диссертации

2017 год

• «Изучение экспрессии генов прохимозина верблюда и альпака в системе Escherichia coli» (Балабова Д.В.)

2023 год

• «Исследование комплекса биохимических свойств рекомбинантных химозинов тихоокеанского белобокого дельфина (Lagenorhynchus obliquidens) и белухи (Delphinapterus leucas)» (Щеголькова В.О.)

2024 год

• «Биохимическая характеристика рекомбинантных химозинов овцебыка и такина, полученных в дрожжевой системе экспрессии» (Белаш Е.А.)
• «Оптимизация методов получения конъюгатов на основе инженерного варианта белка А» (Гайваронский С.И.)
• «Оптимизация условий синтеза и определение активности мутантных форм рекомбинантной Taq-полимеразы» (Маслов Р.Д.)

Научные квалификационные работы

2021 год

• «Изменение свойств химозина под влиянием факторов мутагенеза» (Балабова Д.В.)

НАУЧНЫЕ ПУБЛИКАЦИИ КОЛЛЕКТИВА ЦЕНТРА

Научные статьи

• Piven Yu.A., Zinovich V.G., Shcherbakov D.N., Chirkova V.Yu., Belenkaya S.V., Puzanau R.M., Khlebnicova T.S., Lakhvich F.A. Computer-aided design, synthesis and evaluation of new SARS-CoV-2 Mpro inhibitors based on 1,5,6,7-tetrahydro-4h-indazol-4-one scaffold // Medicinal Chemistry Research. – 2024. – Vol. 33. – No 1. – С. 151–163.
• Чиркова В.Ю., Щербаков Д.Н., Колосов П.В., Ширманов М.В., Колосова Е.А., Малкова А.В., Шарлаева Е.А., Иркитова А.Н., Евдокимов И.Ю. Получение α-амилазы Bacillus amyloliquefaciens в экспрессионной системе Bacillus mojavensis и свойства рекомбинантного фермента // Биотехнология. – 2024. – Т. 40. – № 1. – P. 42–50.
• Yarovaya O.I., Filimonov A.S., Baev D.S., Borisevich S.S., Zaykovskaya A.V., Chirkova V.Yu., Marenina M.K., Meshkova Yu.V., Belenkaya S.V., Shcherbakov D.N., Gureev M.A., Luzina O.A., Pyankov O.V., Salakhutdinov N.F., Khvostov M.V. The potential of usnic-acid-based thiazolo-thiophenes as inhibitors of the main protease of SARS-CoV-2 viruses // Viruses. – 2024. – Vol. 16. – No 2. – P. 215.
• Полтавченко А.Г., Ерш А.В., Ушкаленко Н.Д., Филатов П.В., Колосова Е.А., Шаньшин Д.В., Щербаков Д.Н. Оценка эффективности применения конъюгатов куриных IgY антител против IgG человека в иммуноферментном и дот-иммуноанализе // Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. – 2024. – Т. 13. – № 1(48). – С. 6–14.
• Чиркова В.Ю., Щербаков Д.Н., Шарлаева Е.А., Ширманов М.В., Колосов П.В., Колосова Е.А., Иркитова А.Н., Малкова А.В., Дудник Д.Е., Каргашилова Е.Н., Евдокимов И.Ю. Оценка ферментативной активности рекомбинантной фосфолипазы C, полученной в системе Bacillus mojavensis // В книге: Биотехнология: состояние и перспективы развития. Материалы международного конгресса. Москва, 2023. – С. 25–27.
• Balabova D.V., Belash E.A., Belenkaya S.V., Shcherbakov D.N., Belov A.N., Koval A.D., Mironova A.V., Bondar A.A., Volosnikova E.A., Arkhipov S.G., Sokolova O.O., Chirkova V.Y., Elchaninov V.V. Biochemical properties of a promising milk-clotting enzyme, moose (Alces alces) recombinant chymosin // Foods. – 2023. – Vol. 12. – No 20. – P. 3772.
• Yarovaya O.I., Filimonov A.S., Baev D.S., Borisevich S.S., Chirkova V.Yu., Zaykovskaya A.V., Mordvinova E.D., Belenkaya S.V., Shcherbakov D.N., Luzina O.A., Pyankov O.V., Salakhutdinov N.F. Usnic acid based thiazole-hydrazones as multi-targeting inhibitors of a wide spectrum of SARS-CoV-2 viruses // New Journal of Chemistry. – 2023. – Vol. 47. – No 43. – P. 19865–19879.
• Чиркова В.Ю., Щербаков Д.Н., Шарлаева Е.А., Ширманов М.В., Колосов П.В., Колосова Е.А., Иркитова А.Н., Малкова А.В., Дудник Д.Е., Каргашилова Е.Н., Евдокимов И.Ю. Оценка ферментативной активности рекомбинантной фосфолипазы C, полученной в системе Bacillus mojavensis при глубинном культивировании в полупромышленных ферментерах // Биотехнология. – 2023. – Т. 39. – № 2. – С. 17–22.
• Belenkaya S.V., Shcherbakov D.N., Chapoval A.I., Esina T.I., Elchaninov V.V. The effect of thioredoxin and prochymosin coexpression on the refolding of recombinant alpaca chymosin // Vavilov Journal of Genetics and Breeding. – 2023. – Vol. 27. – No 4. – P. 421–427.
• Колосова Е.А., Колосов П.В., Меркульева Ю.А., Щербаков Д.Н. Оптимизация условий экспрессии рекомбинантных антигенов-кандидатов вакцин против ценуроза // Актуальная биотехнология. – 2023. – № 1. – С. 57–58.
• Белаш Е.А., Щербаков Д.Н., Колосова Е.А., Балабова Д.В. Получение рекомбинантного ангиогенина человека в дрожжах Saccharomyces boulardii // Актуальная биотехнология. – 2023. – № 2. – С. 33–34.
• Колосов П.В., Щербаков Д.Н. Оптимизация условий синтеза рекомбинантной мутантной Taq-полимеразы // Актуальная биотехнология. – 2023. – № 3. – С. 48–50.
• Balabova D.V., Belenkaya S.V., Volosnikova E.A., Hermes T., Chirkova V.Y., Sharlaeva E.A., Shcherbakov D.N., Belov A.N., Koval A.D., Elchaninov V.V. Can recombinant tree shrew (Tupaia belangeri chinensis) chymosin coagulate cow (Bos taurus) milk? // Applied Biochemistry and Microbiology. – 2022. – Vol. 58. – No 6. – P. 761–770.
• Колосова Е.А., Шапрова О.Н., Никулина Ю.А., Шаньшин Д.В., Несмеянова В.С., Меркульева Ю.А., Беленькая С.В., Исаева А.А., Щербаков Д.Н., Ельчанинова С.А., Никонорова М.А. Антитела к рецептор-связывающему домену спайкового белка SARS-CoV-2: связь с возрастом, пневмонией, длительностью периода после COVID-19 // Журнал инфектологии. – 2022. – Т. 14. – № 1. – С. 69–77.
• Balabova D.V., Rudometov A.P., Belenkaya S.V., Belov A.N., Koval A.D., Bondar A.A., Bakulina A.Yu., Rukhlova E.A., Elchaninov V.V., Shcherbakov D.N. Biochemical and technological propertiesof moose (Alces alces) recombinant chymosin // Vavilov Journal of Genetics and Breeding. – 2022. – Vol. 26. – No 3. – P. 240–249.
• Викторина О.Е., Колосова Е.А., Шаповал А.И., Щербаков Д.Н. Получение рекомбинантных корегуляторных мишеней в эукариотической системе // В книге: IX Международная конференция молодых ученых: вирусологов, биотехнологов, биофизиков, молекулярных биологов и биоинформатиков. Сборник тезисов. Новосибирск, 2022. – С. 111.
• Колосова Е.А., Бондарь А.А., Шаповал А.И., Щербаков Д.Н., Морозов И.В. Анализ результатов фагового дисплея на платформе ION // В книге: Высокопроизводительное секвенирование в геномике (HSG-2022). Сборник тезисов III Всероссийской конференции. Новосибирск, 2022. – С. 29.
• Белаш Е.А., Колосов П.В., Балабова Д.В., Беленькая С.В., Щербаков Д.Н. Анализ влияния независимых параметров на продукцию рекомбинантного химозина лося дрожжами Kluyveromyces lactis // В книге: IX Международная конференция молодых ученых: вирусологов, биотехнологов, биофизиков, молекулярных биологов и биоинформатиков. Сборник тезисов. Новосибирск, 2022. – С. 82–83.
• Белаш Е.А., Балабова Д.В., Беленькая С.В., Ельчанинов В.В., Щербаков Д.Н. Первичная биохимическая характеристика рекомбинантного химозина лося (Alces alces), полученного в системе экспрессии дрожжей Kluyveromyces lactis // В книге: Международный конгресс "Биотехнология: состояние и перспективы развития". Материалы конгресса. Москва, 2022. – С. 173–174.
• Беленькая С.В., Чиркова В.Ю., Шарлаева Е.А., Ельчанинов В.В., Щербаков Д.Н. Параметры ферментативной кинетики рекомбинантного химозина алтайского марала (Cervus elaphus sibiricus), полученного в про- и эукариотической системах экспрессии // Биотехнология. – 2022. – Т. 38. – № 5. – С. 11–16.
• Antibodies to the spike protein receptor-binding domain of SARS-CoV-2 AT 4-13 months after COVID-19 // Kolosova E.A., Shaprova O.N., Shanshin D.V., Nesmeyanova V.S., Merkuleva Iu.A., Belenkaya S.V., Isaeva A.A., Nikitin A.O., Volosnikova E.A., Nikulina Yu.A., Nikonorova M.A., Shcherbakov D.N., Elchaninova S.A. Journal of Clinical Medicine. – 2022. – Vol. 11. – No 14. – P. 4053.
• Колосова Е.А., Щербаков Д.Н., Шаповал А.И., Викторина О.Е. Конструирование векторов, обеспечивающих экспрессию некоторых лигандов ко-регуляторных молекул в клетках яичников китайского хомячка (CHO-M) // Труды молодых ученых Алтайского государственного университета. – 2022. – № 19. – С. 14–16.
• Колосова Е.А., Викторина О.Е., Шаповал А.И., Щербаков Д.Н. Поиск пептидов, специфически связывающихся с корегуляторной мишенью B7-2 // Биоорганическая химия. – 2021. – Т. 47. – № 6. – С. 762–767.
• Podlesnykh S.V., Abramova K.E., Gordeeva A., Chapoval A.I., Khlebnikov A.I. Peptide blocking CTLA-4 and B7-1 interaction // Molecules. – 2021. – Vol. 26. – № 2: 253.
• Шаповал А.И., Подлесных С.В. Пептидные микрочипы для иммунодиагностики онкологических заболеваний и разработки иммунотерапевтических препаратов // Клиническая лабораторная диагностика. – 2021. – Т. 66. – № S4. – С. 75–76.
• Колосова Е.А., Никулина Ю.А., Щербаков Д.Н., Никонорова М.А., Смирнова А.А., Смирнова О.И., Попкова Л.Н., Ельчанинова С.А. Антитела к спайковому белку SARS-CoV-2 после новой короновирусной инфекции COVID-19 // Журнал инфектологии. – 2021. – Т. 13. – № 2 S1. – С. 45.
• Балабова Д.В., Миронова А.В., Пушкарев В.А., Афанасьева Ю.Г., Щербаков Д.Н., Рудометов А.П., Ельчанинов В.В. Влияние аминокислотных замен в молекуле рекомбинантного химозина коровы на зависимость его коагуляционной активности от концентрации хлорида кальция в молоке // Биотехнология. – 2021. – Т. 37. – № 1. – С. 81–86.
• Белаш Е.А., Балабова Д.В., Щербаков Д.Н. Изучение влияния бактериальных белков-шаперонов на синтез и транспорт рекомбинантного химозина лося // Труды молодых ученых Алтайского государственного университета. – 2021. – № 18. – С. 5–8.
• Белаш Е.А., Балабова Д.В., Щербаков Д.Н. Оптимизация условий наработки химерного прохимозина лося в системе E. coli // В сборнике: От биопродуктов к биоэкономике. Материалы IV межрегиональной научно-практической конференции (с международным участием). Барнаул, 2021. – С. 167–170.
• Щеголькова В.О., Балабова Д.В., Щербаков Д.Н. Влияние аминокислотных замен на синтез и локализацию рекомбинантного прохимозина верблюда // В сборнике: от биопродуктов к биоэкономике. Материалы IV межрегиональной научно-практической конференции (с международным участием). Барнаул, 2021. – С. 252–255.
• Шаповал А.И., Подлесных С.В., Колосова Е.А., Щербаков Д.Н., Шойхет Я.Н., Лазарев А.Ф., Вихлянов И.В., Синкина Т.В., Джонстон С.А. Репертуар циркулирующих антител при различных молекулярных подтипах рака молочной железы // В книге: Белые ночи 2020. Тезисы VI Петербургского международного онкологического форума, 2020. – С. 149.
• Подлесных С.В., Лампатов В.В., Хлебников А.И., Шаповал А.И. Молекулярный докинг и экспериментальная оценка пептида, взаимодействующего с CTLA-4 // Биомедицинская химия. – 2020. – Т. 66. – № 2. – С. 156–161.
• Pisarev V.M., Shapoval A.I., Petrova M.V., Podlesnykh S.V., Mitiashin A., Kalov A. Toward detecting the antibody signature(S) to predict life-threatening sepsis in chronic critical illness // Shock. – 2020. – Vol. 53. – No S1. – P. 96–97.
• Колосова Е.А., Морозов И.В., Бондарь А.А., Шаповал А.И., Гершони Дж.М., Щербаков Д.Н. Изучение разнообразие фаговых пептидных библиотек при помощи массового параллельного секвенирования // В книге: Биотехнология - медицине будущего. Материалы всероссийской мультиконференции с международным участием, 2019. – С. 178.
• Подлесных С.В., Колосова Е.А., Щербаков Д.Н., Шойхет Я.Н., Лазарев А.Ф., Вихлянов И.В., Синкина Т.В., Джонстон С.А., Ильичев А.А., Шаповал А.И. Определение молекулярных подтипов рака молочной железы на основе анализа репертуара циркулирующих антител с помощью пептидных микрочипов // Успехи молекулярной онкологии. – 2019. – Т. 6. – № S4. – С. 106.
• Подлесных С.В., Мурашкин Д.Е., Колосова Е.А., Щербаков Д.Н., Лампатов В.В., Хлебников А.И., Джонстон С.А., Шаповал А.И. Пептиды, взаимодействующие с молекулой CTLA-4 (ЧЕКПОИНТ) для иммунотерапии рака // Успехи молекулярной онкологии. – 2019. – Т. 6. – № S4. – С. 157.
• Chapoval A.I., Shcherbakova N.S., Shcherbakov D.N., Chapoval S.P. Immune checkpoints of the B7 family. Part 1. General characteristics and first representatives: B7-1, B7-2, B7-H1, B7-H2, and B7-DC // Russian Journal of Bioorganic Chemistry. – 2019. – Vol. 45. – No 4. – P. 225–240.
• Chapoval A.I., Shcherbakova N.S., Shcherbakov D.N., Chapoval S.P. Immune checkpoints of the B7 family. Part 2. Representatives of the B7 FAMILY B7-H3, B7-H4, B7-H5, B7-H6, B7-H7, and ILDR2 and their receptors // Russian Journal of Bioorganic Chemistry. – 2019. – Vol. 45. – No 5. – P. 321–334.
• Podlesnykh S.V., Kolosova E.A., Shcherbakov D.N., Chapoval A.I., Shanshin D.V., Murashkin D.E., Shaprova O.N. Development of search strategy for peptide inhibitors of immune checkpoints // Russian Journal of Bioorganic Chemistry. – 2018. – Vol. 44. – No 2. – P. 150–157.
• Подлесных С.В., Колосова Е.А., Щербаков Д.Н., Шойхет Я.Н., Лазарев А.Ф., Джонстон С.А., Шаповал А.И. Репертуар циркулирующих антител (иммуносигнатура) как биомаркер онкологических заболеваний // В книге: Опухолевые маркеры: фундаментальные и клинические аспекты. Материалы конференции, посвященной памяти советского и российского ученого Гарри Израйлевича Абелева, 2018. – С. 87–88.
• Подлесных С.В., Шаньшин Д.В., Колосова Е.А., Мурашкин Д.Е., Шапрова О.Н., Щербаков Д.Н., Шойхет Я.Н., Лазарев А.Ф., Шаповал А.И. Новая исследовательская платформа для создания иммунодиагностических и иммунотропных средств // В книге: Биотехнология: состояние и перспективы развития. Материалы международного форума, 2018. – С. 359–360.
• Подлесных С.В., Колосова Е.А., Анисимов Д.С., Щербаков Д.Н., Рязанов М.А., Петрова В.Д., Шойхет Я.Н., Johnston S.A., Лазарев А.Ф., Шаповал А.И. Высокоспецифичный и чувствительный анализ репертуара сывороточных антител с помощью пептидных микрочипов у пациентов с диагнозом рак молочной железы // Клиническая лабораторная диагностика. – 2017. – Т. 62. – № 9. – С. 557–563.
• Шаповал А.И., Подлесных С.В., Колосова Е.А., Щербаков Д.Н. Новые точки контроля иммунного ответа для иммунотерапии онкологических заболеваний // Российский онкологический журнал. – 2017. – Т. 22. – № 4. – С. 175–179.
• Анисимов Д.С., Подлесных С.В., Колосова Е.А., Щербаков Д.Н., Петрова В.Д., Джонстон С.А., Лазарев А.Ф., Оскорбин Н.М., Шаповал А.И., Рязанов М.А. Анализ многомерных данных пептидных микрочипов с использованием метода проекции на латентные структуры // Математическая биология и биоинформатика. – 2017. – Т. 12. – № 2. – С. 435–445.
• Подлесных С.В., Колосова Е.А., Анисимов Д.С., Щербаков Д.Н., Рязанов М.А., Петрова В.Д., Джонстон С.А., Шойхет Я.Н., Лазарев А.Ф., Шаповал А.И.Микрочипы с пептидами со случайными аминокислотными последовательностями для определения иммуносигнатур и диагностики рака молочной железы // В книге: Биотехнология - медицине будущего. Материалы всероссийской конференции с международным участием, 2017. – С. 87.
• Podlesnykh S.V., Kolosova E.A., Shcherbakov D.N., Shaidurov A.A., Anisimov D.S., Ryazanov M.A., Chapoval A.I., Johnston S.A., Shoikhet Y.N., Petrova V.D., Lazarev A.F. Interaction of serum antibodies from breast cancer patients with synthetic peptides // Bulletin of Experimental Biology and Medicine. – 2016. – Vol. 161. – No 6. – P. 816–820.
• Шаповал А.И., Подлесных С.В., Колосова Е.А., Требухов А.В., Щербаков Д.Н., Джонстон С.А., Петрова В.Д., Шойхет Я.Н., Лазарев А.Ф. Анализ репертуара антител (иммуносигнатур) с помощью пептидных микрочипов для диагностики онкологических заболеваний // Российский онкологический журнал. – 2015. – Т. 20. – № 4. – С. 53–54.
• Шаповал А.И., Подлесных С.В., Курчанова Е.А. (Колосова) Молекулярный подход к диагностике и лечению злокачественных новообразований до их визуализации // Проблемы клинической медицины. – 2014. – № 3. – С. 14.

Патенты на изобретение

• Рекомбинантная плазмида pbu-sav, обеспечивающая синтез и секрецию белка щелочной протеазы в системе Bacillus subtilis. Щербаков Д.Н., Чиркова В.Ю., Колосов П.В., Меркульева Ю.А., Ширманов М.В., Малкова А.В. Патент на изобретение RU 2816513 C1, 01.04.2024. Заявка от 15.02.2023.
• Рекомбинантная плазмида pBU-LipA, обеспечивающая синтез белка липазы А штамма Bacillus natto IAN. Щербаков Д.Н., Колосов П.В., Каргашилова Е.Н., Иркитова А.Н. Патент на изобретение RU 2808501 C1, 28.11.2023. Заявка от 15.02.2023.
• Пептид, специфически взаимодействующий с молекулой контроля иммунного ответа B7-2 (CD86) человека. Колосова Е.А., Викторина О.Е., Щербаков Д.Н., Шаповал А.И. Патент на изобретение RU 2808419 C1, 28.11.2023. Заявка от 29.11.2022.
• Нонапептидный антагонист взаимодействия молекул CTLA-4 и В7-1. Подлесных С.В., Шаповал А.И. Патент на изобретение RU 2771331 C9, 07.07.2022. Заявка № 2021130576 от 19.10.2021.
• Тетрадекапептидный антагонист взаимодействия CTLA-4 C B7-1. Подлесных С.В., Шаповал А.И. Патент на изобретение RU 2757418 C1, 15.10.2021. Заявка № 2021105718 от 04.03.2021.
• Рекомбинантная плазмида pET21-TF7, обеспечивающая синтез модифицированного тканевого фактора, и штамм Escherichia coli BL21(DE3) pET21-TF7 - продуцент рекомбинантного тканевого фактора человека. Щербаков Д.Н., Ельчанинов В.В., Шаньшин Д.В., Балабова Д.В., Коваль А.Д., Ерин Д.Н. Патент на изобретение RU 2744592 C1, 11.03.2021. Заявка № 2020121616 от 25.06.2020.
• Пептид со способностью специфически связываться с молекулой контроля иммунного ответа CTLA-4. Подлесных С.В., Шаповал А.И. Патент на изобретение RU 2747793 C1, 14.05.2021. Заявка № 2020120137 от 10.06.2020.
• Набор пептидов со способностью специфически связываться с циркулирующими антителами плазмы крови пациентов для диагностики заболевания рак молочной железы. Подлесных С.В., Шаповал А.И., Шойхет Я.Н., Лазарев А.Ф. Патент на изобретение RU 2750463 C1, 28.06.2021. Заявка № 2020124057 от 13.07.2020.

Базы данных

• Полиморфизм нуклеотидных последовательностей вируса папилломы человека. Колосов П.В., Щербаков Д.Н., Колосова Е.А. Свидетельство о регистрации базы данных RU 2023624368, 04.12.2023. Заявка от 21.11.2023.
• База данных клинико-патологических и морфологических параметров больных раком молочной железы для обнаружения биомаркеров при ранней диагностики заболевания. Шаповал А.И., Лазарев А.Ф., Петрова В.Д., Подлесных С.В., Рязанов М.А. Свидетельство о регистрации базы данных RU 2017621486, 14.12.2017. Заявка № 2017621205 от 26.10.2017.

Диссертации

• Подлесных С.В. Исследование репертуара циркулирующих антител и белок-белковых взаимодействий с использованием пептидных микрочипов. Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук – Федеральное Государственное Бюджетное Научное Учреждение "Федеральный исследовательский центр фундаментальной и трансляционной медицины", 2021.
• Шаповал А.И. Новые костимуляторные молекулы семейства В7 и роль костимуляции в активации NK-клеток. Диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук – Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук, 2019.

Историческая справка  - Центр рекомбинантных технологий (до 2024 г. – РАПРЦ)

2013 г. (Июнь): Создание

В рамках реализации программы стратегического развития ФГБОУ ВПО «Алтайский государственный университет» с 24 по 27 июня в Алтайском государственном университете пройдут мероприятия, предусмотренные меморандумом о сотрудничестве с Университетом штата Аризона (США). Центральной темой для обсуждения станет вопрос о создании совместного Российско-Американского противоракового центра на базе Алтайского государственного университета. С американской стороны в создании центра участвуют ученые Университета штата Аризона (Стефен Джонстон и Анатолий Коркин) с российской стороны − ученые Алтайского государственного университета, Алтайского государственного медицинского университета, специалисты Алтайского краевого онкологического центра «Надежда», а также ученые Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН и Института клинической иммунологии СО РАМН (г. Новосибирск).

Целью совместной работы российской и американской сторон станет разработка диагностический методик, служащих для ранней диагностики рака и синтетических антител, высокоактивных в лечение некоторых форм рака. Наиболее перспективной представляется разработка методов ранней диагностики, основанных на иммунном ответе организма в ответ на формирование опухоли.        

2015 г. (Февраль): Развитие международного сотрудничества

Дмитрий Николаевич Щербаков, кандидат биологических наук, сотрудник Российско-американского противоракового центра, вернулся из поездки в Израиль, где он познакомился с работой отдела цитологии и иммунологии Тель-Авивского университета.

Заведующий лабораторией Тель-Авивского университета профессор Джонатан Гершони — известный ученый в области молекулярной иммунологии и пептидного фагового дисплея. Как заметил Д.Н. Щербаков, с научными работами Дж. Гершони он познакомился несколько лет назад и заинтересовался ими. В ходе поездки в Израиль Д.Н. Щербакову удалось встретиться с профессором Гершони, обсудить целый ряд актуальных вопросов, в том числе условия договора о сотрудничестве между АлтГУ и Тель-Авивским университетом по ряду перспективных направлений образовательной и научной деятельности, который будет подписан в ближайшее время. Коллеги из Израиля с большой охотой откликнулись на предложение о сотрудничестве. Результаты и наработки, полученные научным коллективом профессора Гершони будут актуальны и для исследований Российско-американского противоракового центра АлтГУ.        

2015 г. (Май):

В Российско-американском противораковом центре Алтайского государственного университета начался эксперимент по сравнению иммуносигнатур в образцах сыворотки крови пациентов с диагнозом рака молочной железы из России и США. Эксперимент проводят ученые РАПРЦ АлтГУ, Алтайского краевого онкологического центра «Надежда» и Государственного университета штата Аризона (США).

Для участия в эксперименте в АлтГУ приехал профессор института биодизайна университета штата Аризона Збигнев Чихач.

Тестирование иммуносигнатуры началось 12 мая одновременно в Российско-американском противораковом центре Алтайского государственного университета и Государственном университете штата Аризона (США). Эксперимент продолжится до 15 мая.

2016 г. (Ноябрь):

Аспирант биологического факультета Алтайского государственного университета, сотрудник Российско-американского противоракового центра АлтГУ Степан Подлесных выиграл грант программы «Участник молодежного научно-инновационного конкурса» (У.М.Н.И.К.).

На конкурс он представил проект «Разработка прототипа нового иммуномодулятора для терапии рака», который является своего рода следующим шагом в научной деятельности Российско-американского противоракового центра АлтГУ. Это уже не диагностика онкозаболеваний с помощью иммуносигнатуры, а их терапия с использованием пептидов, расположенных на микрочипах.

Основная цель проекта – с помощью микрочипов найти пептиды (молекулы, составные части белка, являющиеся строительным материалом человеческого организма), обладающие иммуномодуляторными свойствами, которые в будущем можно будет использовать вместо моноклональных антител в терапии онкологических заболеваний.

2017 г. (Январь):

Научный проект Алтайского госуниверситета под названием «Разработка лекарственных препаратов на основе синтетических пептидов для блокировки костимуляторных молекул», руководителем которого выступает исполнительный директор Российско-американского противоракового центра АлтГУ, к.б.н. Андрей Иванович Шаповал, получили финансовую поддержку Министерства образования и науки РФ в виде государственного задания. Финансирование проекта рассчитано на три года, а ожидаемый результат проекта заключается в том, что ученые АлтГУ создадут препараты, готовые пройти серьезную фармакологическую и доклиническую оценку. Все, по словам Андрея Ивановича, будет зависеть от их функциональной активности.

2017 г. (Май):

Исследования противоракового центра АлтГУ были представлены в Вашингтоне, где состоялась конференция Американской ассоциации иммунологов, в работе которой принял участие исполнительный директор Российско-американского противоракового центра Алтайского государственного университета, кандидат биологических наук Андрей Иванович Шаповал, выступив с презентацией результатов работы Российско-американского противоракового центра Алтайского госуниверситета в области исследования иммуносигнатуры с помощью пептидных микрочипов у пациентов с диагнозом "рак молочной железы".

2017 г. (Август):

Российско-американский противораковый центр Алтайского государственного университета вошел в число победителей конкурса проектов фундаментальных научных исследований, проводимого совместно Российским фондом фундаментальных исследований и Национальным институтом онкологии США. Проект «Иммунносигнатуры для определения подтипов рака молочной железы и прогнозирования рецидива», научным руководителем которого выступает исполнительный директор Российско-американского противоракового центра АлтГУ, к.б.н. Андрей Иванович Шаповал, вошел в число 10 работ, получивших по результатам экспертизы, проведенной независимо российской и американской сторонами, финансовую поддержку. 

2017 г. (Сентябрь):

Международный семинар Российско-американского противоракового центра (РАПРЦ) по теме «Молекулярные методы диагностики и лечения заболеваний человека».

Ведущие спикеры –председатель комитета Алтайского краевого законодательного собрания по здравоохранению и науке, главный врач Краевого онкологического диспансера, д.м.н., член-корреспондент РАЕ, профессор Александр Федорович Лазарев, руководитель Алтайского краевого пульмонологического центра, заслуженный деятель науки РФ, д.м.н., член-корреспондент РАН, профессор Яков Наумович Шойхет, известный американский ученый, специалист в области ранней иммунодиагностики и ранней профилактики рака, профессор-иммуноонколог из Университета штата Аризона (США) Стефен Джонстон, декан биологического факультета Челябинского государственного университета, д.м.н., профессор Александра Леонидовна Бурмистрова и др.

Организаторы – Алтайский государственный университет (АлтГУ), Алтайский филиал Российского онкологического научного центра им. Н.Н. Блохина (РОНЦ), Алтайский государственный медицинский университет (АГМУ), Университет Штата Аризона (США).

2018 г. (Ноябрь):

В Российско-американском противораковом центре АлтГУ началась разработка уникальной технологии ранней диагностики онкозаболеваний на основе фагового дисплея.

2019 г. (Ноябрь):

На Festival of Biologics 2019 в Швейцарии представили результаты работы РАПРЦ АлтГУ.

Директор Российско-Американского противоракового центра опорного Алтайского государственного университета Андрей Иванович Шаповал принял участие в Международном фестивале биохимии, биофармацевтики и медицинских исследований Festival of Biologics 2019, прошедшем в швейцарском городе Базеле, став участником секции «Точки контроля иммунного ответа», где представил доклад о разработках Российско-Американского противоракового центра АлтГУ в области иммунотерапевтических пептидов.

2020 г. (Декабрь):

Ученые АлтГУ и ИНХ СО РАН разработали наночастицы, способные помочь в диагностике онкозаболеваний. Авторитетный научный журнал Nanoscale, издаваемый Королевским химическим обществом Великобритании, опубликовал результаты совместной исследовательской работы ученых Российско-Американского противоракового центра Алтайского государственного университета и Института неорганической химии им. А.В. Николаева Сибирского отделения Российской академии наук. Научные сотрудники Российско-американского противоракового центра АлтГУ совместно с коллегами – преподавателями кафедры физико-химической биологии и биотехнологии Института биологии и биотехнологии АлтГУ под руководством академика РАН Ольги Ивановны Лаврик исследуют возможность использования наночастиц для повышения эффективности ранней диагностики онкологических заболеваний. Следующих их шагом стала реализация проекта с учеными Института неорганической химии им. А.В. Николаева СО РАН.

В частности, в статье в британском издании представлены результаты разработки и использования гибридных наночастиц, содержащих комплексы молибдена и однодоменных антител. По мнению ученых, подобные частицы могут выступать в качестве средства визуализации раковой опухоли.

2021 г. (Июль):

Сотрудники Российско-американского противоракового центра (РАПРЦ) Алтайского госуниверситета в сотрудничестве с краевым онкодиспансером и Алтайским медуниверситетом получили патент на набор пептидов для диагностики рака молочной железы. Технология иммуносигнатуры поможет выявлять онкозаболевание на ранней стадии.

2022 г. (Апрель):

Коллектив ученых РАПРЦ Алтайского госуниверситета совместно с коллегами из Новосибирска и Уфы решает задачу по импортозамещению в области рекомбинантных ферментов, востребованных в пищевой промышленности, АПК, химической и фармацевтической отраслях. Основные усилия команда ученых направила на производство молокосвертывающих ферментов, от наличия и доступности которых зависит развитие отечественной отрасли сыроделия. 

2022 г. (Июль):

Ученые Российско-американского противоракового центра АлтГУ вместе с монгольскими коллегами работают над поиском лекарств от коронавируса.

В рамках проекта «Разработка комплексного метода выделения и in vitro анализа биологически активных фракций лекарственных растений», поддержанного Российским фондом фундаментальных исследований в 2020 году, сформирован уникальный международный коллектив по изучению химического состава и биологической активности лекарственных растений, произрастающих на территориях Алтайского края, Республики Алтай и Монголии.

Между учеными налажено взаимовыгодное сотрудничество: российские специалисты имеют доступ к растениям-эндемикам Монголии, их монгольские коллеги имеют в своем распоряжении ряд современных методов оценки in vitro активности химических соединений и другие наработки российских ученых в области химии природных соединений. Примечательно, что эти методы собраны в рамках одной лаборатории и не разрозненны.

Старший научный сотрудник Российско-американского противоракового центра АлтГУ Петр Колосов посетил Институт биомедицинских наук (Institute of biomedical sciences)  с целью проработки протоколов исследований экстрактов, полученных за два года реализации проекта, и показавших ингибирующую активность против коронавирусной протеазы 3CL pro. 

2022 г. (Ноябрь):

Ученые Российско-американского противоракового центра Алтайского государственного университета вместе с коллегами из Новосибирска, Кольцово и Уфы на основе усниновой кислоты, выделенной из лишайников, синтезировали вещества, подавляющие рост трех разных штаммов COVID-19. Эти соединения, связываясь с белками на поверхности вируса и меняя их пространственную структуру, препятствуют проникновению возбудителя в человеческие клетки. Полученные данные помогут разработать новые препараты для борьбы с разными штаммами патогена.

2023 г. (Январь):

В РАПРЦ реализуется проект «Разработка конъюгатов белка А для иммунохимических анализов»  магистранта института биологии и биотехнологии АлтГУ Сергея Гайворонского, который одержал победу в грантовой программе «УМНИК» Фонда содействия инновациям. Конъюгаты на основе рекомбинантного белка А будут использованы в  качестве маркеров в научных исследованиях и медицинской диагностике.

2023 г. (Март):

В составе большого научного коллектива ученые Российско-американского противоракового центра АлтГУ расшифровали трехмерную структуру химозина алтайского марала. Рекомбинантный химозин марала — это фермент, полностью аналогичный тем, что выделяется слизистой оболочкой желудка оленят в период молочного вскармливания. Он способен заменить импортные препараты рекомбинантных молокосвертывающих ферментов, широко используемых в сыроделии.

2023 г. (Апрель):

Проект ученых Алтайского государственного университета по получению штамма-продуцента рекомбинантной фосфолипазы С получил грант губернатора Алтайского края для разработки качественно новых технологий, создания инновационных продуктов и услуг в сферах переработки и производства пищевых продуктов, фармацевтического производства и биотехнологий. Над проектом «Разработка высокоэффективных биопрепаратов для кормопроизводства и растениеводства, в частности  продуцента и технологии производства рекомбинантной фосфолипазы С» работают ученые Российско-американского противоракового центра АлтГУ и ИЦ «Промбиотех» АлтГУ.

2023 г. (Май):

Ученые Российско-американского противоракового центра АлтГУ разрабатывают импортозамещающую тест-систему для определения онкогенных типов вируса папилломы человека (ВПЧ). Проект будет способствовать внедрению в лечебно-оздоровительные учреждения Алтайского края научно-обоснованной технологии, способствующей снижению уровня заболеваемости онкологическими заболеваниями.

2023 г. (Октябрь):

Разработка ученых Российско-американского противоракового центра АлтГУ для определения онкогенных типов вируса папилломы человека (ВПЧ) перешла в стадию испытаний.

Коллектив Российско-американского противоракового центра АлтГУ (РАПРЦ) в рамках «Программы Приоритет 2030» продолжает реализацию проекта «Метод видоспецифичной идентификации онкогенных видов ВПЧ на основе мультиплексной ПЦР в реальном времени».

Ученые сотрудничают с новосибирской компанией «Имбиан Лаб», которая разрабатывает и производит медицинские тест-системы для диагностики различных заболеваний. Они предложили разработать прототип набора для определения онкогенных типов ВПЧ.

2023 г. (Ноябрь):

Ученые АлтГУ получают ценный ранозаживляющий белок с помощью дрожжей.

Ученые Российско-американского противоракового центра Алтайского государственного университета в рамках «Программы Приоритет 2030» реализуют проект «Разработка универсального плазмидного вектора для экспрессии генов в дрожжах Saccharomyces boulardii». Основным объектом изучения в рамках проекта является ангиогенин. Это белок, мощный биостимулятор образования кровеносных сосудов – перспективное лекарственное средство. Ангиогенин способствует заживлению ран, трофических язв, ожогов, лечению инфарктов, церебральных тромбозов и других заболеваний. В рамках проекта ученые научились получать ангиогенин на основе безопасных и даже полезных для организма дрожжей Saccharomyces boulardii. Их используют, например, для лечения различных заболеваний кишечника.

2024 г. (Май):

Переименование Российско-американского противоракового центра АлтГУ в Центр рекомбинантных технологий ФГБОУ ВО "Алтайский государственный университет"

Сотрудники ЦРТ/РАПРЦ, внесшие большой вклад в становление и развитие Центра:

1. Андрей Иванович Шаповал, выпускник АлтГУ, в октябре 2013 года он после 20 лет, проведенных в США, вернулся в Барнаул и возглавил Российско-американский противораковый центр на базе Алтайского госуниверситета.

2. Стефен Джонстон, директор Центра инновационной медицины, Университет штата Аризона (США). Известный американский ученый, специалист в области ранней иммунодиагностики и ранней профилактики рака, профессор-иммуноонколог.

3. Александр Фёдорович Лазарев, главный врач Алтайского краевого онкологического диспансера, директор КГБУЗ «Алтайский онкологический центр», доктор медицинских наук, профессор, зав. кафедрой онкологии АГМУ.

4. Яков Нахманович Шойхет, заведующий кафедрой  факультетской хирургии с курсом хирургии ФПК и ППС АГМУ, член-корреспондент РАМН, доктор медицинских наук, профессор.