Одним из основных партнеров ВКГУ им. С. Аманжолова является Алтайский государственный университет (Российская Федерация). А одним из перспективных видов сотрудничества является совместная образовательная программа - программа двух дипломов.
В Алтайском государственном университете (г. Барнаул) активно ведется работа по реализации совместных образовательных программ и программ академической мобильности для студентов в зарубежные вузы-партнеры.
Так, одним из перспективных видов сотрудничества является совместная образовательная программа (программа двух дипломов). Бакалавры и магистранты по физике, радиофизике, информатике и вычислительной технике и информационной безопасности могут иметь возможность получить дипломы государственного образца Республики Казахстан и Российской Федерации.