Кафедра археологии, этнографии и музеологии, являясь подразделением исторического факультета АлтГУ, ведет обучение бакалавров, специалистов и магистрантов по нескольким направлениям подготовки. Она была образована в 1988 г. и первоначально называлась кафедрой археологии, этнографии и источниковедения. До мая 2014 г. кафедру возглавлял Юрий Федорович Кирюшин – доктор исторических наук, профессор, действительный член Международной академии высшего образования, член-корреспондент Российской академии естественных наук, Президент Алтайского государственного университета.
Коллектив кафедры выполняет значительный объем научных исследований. Это находит отражение в существенном объеме финансируемых проектов, в большом количестве изданных трудов, защищенных диссертаций, проведенных конференций, экспедиционных изысканий на территории Алтайского края, Республики Алтай и за рубежом (Монголия, Казахстан, Китай).
В 2004 г. кафедра стала базовой для реализации на факультете специальности «Музеология. Организация экскурсионно-туристической деятельности». В настоящее время осуществляется подготовка бакалавров и магистрантов по направлению «Музеология и охрана объектов культурного и природного наследия». Действуют аспирантура и докторантура по специальности 07.00.06 – археология.
На протяжении многих лет кафедра АЭМ занимает лидирующие позиции в конкурсе среди аналогичных подразделений АлтГУ. Основные результаты деятельности сотрудников кафедры отражены на Информационно-аналитическом портале «Археология Алтая».