Миссия Алтайского государственного опорного университета – подготовка современных специалистов на основе интеграции науки, образования и бизнеса, готовых к самореализации и способных обеспечить трансфер инновационных знаний и технологий в развитие Алтайского края и регионов Большого Алтая с приоритетами экологического, цифрового профиля и «зеленой» экономики.
Стратегическая цель – реализация инновационной модели университета, расширяющего пространство влияния и сотрудничества, привлекающего идеи и ресурсы, создающего новые возможности в сфере знаний, инноваций, технологий и социальных практик в целях устойчивого развития Алтайского края и регионов Большого Алтая.