Минералогический музей основан в 1991 г. С 2007 переименован в Лабораторию минералогии. Коллекция музея состоит и экспозиционного, фондового и учебного отделов, включающих 1250 образцов минералов и горных пород Алтая и регионов Южной Сибири.
Экспозиция расположена тематическими стендами: